與一般的投資項目相比，清潔發(fā)展機制項目需要滿足額外的要求，經(jīng)歷額外的審批程序等，使得清潔發(fā)展機制項目的開發(fā)給開發(fā)者帶來一些額外的交易成本。清潔發(fā)展機制是一個新的事物，很難準確估計交易成本的大小。據(jù)估計，對于一個大型清潔發(fā)展機制項目而言，交易成本有可能高達 20 萬～ 25 萬美元 (Pembina Institate ， 2003) 。清潔發(fā)展機制項目開發(fā)者需要承擔(dān)的交易成本主要發(fā)生在如下方面：

· 項目搜尋

· 發(fā)展／選擇基準線方法學(xué)并且估計項目減排量

· 準備相關(guān)技術(shù)文件

· 東道國的批準，利益相關(guān)方的咨詢和環(huán)境影響評價

· 準備 CER 購買協(xié)定

· 指定經(jīng)營實體對項目的審定

· 注冊費

· 監(jiān)測

· 核查和核證費用

· 適應(yīng)性費用 ( 總 CERs 的 2 ％ )

· 清潔發(fā)展機制的管理費用

    這其中的一些費用是一次性的，包括：項目搜尋、發(fā)展／選擇基準線方法學(xué)并且估計項目減排量、準備相關(guān)技術(shù)文件、東道國的批準、利益相關(guān)者的咨詢和環(huán)境影響評價、準備 CER 購買協(xié)議、指定經(jīng)營實體對項目的審定、注冊費等。而監(jiān)測費用、核查和核證費用、適應(yīng)性費用和清潔發(fā)展機制的管理費用則是在整個項目過程中一直發(fā)生的。當然，有些費用的發(fā)生與東道國的要求緊密相關(guān)，如果東道國沒有這方面的額外要求，相關(guān)的費用也不會發(fā)生。例如，如果東道國對于清潔發(fā)展機制項目沒有與一般建設(shè)項目相比額外的環(huán)境影響評價要求，則這個交易成本中就不會包括這部分費用。

    有些費用也可以通過適當?shù)姆绞浇档汀１热?，如果東道國政府能夠與投資國政府合作，采取適當?shù)姆绞絹泶龠M兩國企業(yè)間的合作，則項目搜尋成本可以大為降低。隨著經(jīng)過批準的方法學(xué)越來越多，項目開發(fā)者可以選擇應(yīng)用經(jīng)批準的方法學(xué)，而不必自己開發(fā)新的方法學(xué)，從而大大降低確定項目的基準線、監(jiān)測計劃等的成本。隨著國際碳市場上項目經(jīng)驗的逐漸增多，一些交易的 CER 購買合同有可能作為樣本供其他企業(yè)參考，因此也就可以相應(yīng)地降低與此相關(guān)的交易成本。

    越早進入碳市場的企業(yè)，因為相關(guān)的市場經(jīng)驗較少，面臨的交易成本越高。晚進入市場雖然交易成本可以相應(yīng)降低，但有可能會錯失很好的項目合作機遇。考慮到第一承諾期的開始日期越來越近，加之項目的開發(fā)和建設(shè)都需要一定的時間，而且項目只有在開始運行后才能產(chǎn)生減排量，盡早參與國際清潔發(fā)展機制項目合作就顯得越來越重要。