無論是領(lǐng)導(dǎo)干部離任自然資源資產(chǎn)審計，還是政府環(huán)境審計，其審計內(nèi)容均包括合規(guī)性審計、績效審計和財務(wù)審計3個方面。從環(huán)境要素的角度來考慮，又包括對水環(huán)境質(zhì)量、大氣環(huán)境質(zhì)量、廢物管理和生態(tài)環(huán)境質(zhì)量等的審計。

合規(guī)性審計主要審計地方政府落實國家和上級政府有關(guān)環(huán)境保護的法律法規(guī)、環(huán)境標(biāo)準(zhǔn)、環(huán)境規(guī)劃和政策的基本情況。包括是否制定環(huán)境保護目標(biāo)并將目標(biāo)分解到相關(guān)部門，目標(biāo)指標(biāo)是否具體和可考核；針對環(huán)境目標(biāo)落實是否建立實施監(jiān)測監(jiān)控和靈活的調(diào)整機制；是否給予環(huán)境監(jiān)測統(tǒng)計、執(zhí)法監(jiān)察部門充足的資源保障和行動能力；是否預(yù)見到環(huán)境政策實施過程中可能面臨的風(fēng)險并建立風(fēng)險控制和應(yīng)急體系；是否建立環(huán)境目標(biāo)、環(huán)境規(guī)劃和政策實施后評估機制；重大環(huán)境事件發(fā)生后是否按照國家規(guī)定采取妥善應(yīng)急處置情況，是否按照有關(guān)法律規(guī)定實施了責(zé)任追究，追責(zé)是否到位等。

績效審計主要審計地方政府環(huán)境履責(zé)成效，包括是否形成有效的環(huán)境監(jiān)管能力和污染治理能力；主要污染物排放量是否降低；環(huán)境質(zhì)量是否得到切實改善或達到規(guī)定的目標(biāo)；在上述各領(lǐng)域是否達到相關(guān)規(guī)劃和政策的預(yù)期目標(biāo)；規(guī)劃和政策實施是否具有較高的效益費用比，生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)健康是否得到有效保護，公眾健康風(fēng)險是否降低等。

地方政府環(huán)境履責(zé)財務(wù)審計主要針對國家專項環(huán)保資金，從資金管理使用的合法合規(guī)性、資金收支的真實性和資金使用的績效3方面開展。重點審計資金投入所形成的污染治理能力及產(chǎn)生的減排量、形成的環(huán)境監(jiān)管能力，是否達到相關(guān)規(guī)劃和政策目標(biāo)要求等。

與一般審計相比，政府環(huán)境審計重點在于環(huán)境責(zé)任落實情況和環(huán)境履責(zé)成效，這是我國政府環(huán)境審計制度的著力點，也是政府環(huán)境審計制度的生命力所在。

國際上政府環(huán)境審計制度建立晚于企業(yè)環(huán)境審計。美國是最早推行政府環(huán)境審計的國家，最初的環(huán)境審計主要關(guān)注立法的執(zhí)行情況。從20世紀(jì)80年代可持續(xù)發(fā)展概念提出以來，美國環(huán)保局針對日益嚴(yán)重的環(huán)境問題以及政府和企業(yè)環(huán)境保護責(zé)任履行，先后倡導(dǎo)并實施了清潔生產(chǎn)審計、污染場地環(huán)境審計、廢物管理審計等。為推動政府環(huán)境審計開展，美國環(huán)保局專門編制了指導(dǎo)環(huán)境審計實施的技術(shù)指南。隨著荷蘭、加拿大、德國等西方發(fā)達國家政府環(huán)境審計工作的開展，尤其是在世界審計組織（INTOSAI）環(huán)境審計工作組（WGEA）推動下，政府環(huán)境審計的內(nèi)容大大拓展，已經(jīng)覆蓋環(huán)境立法、規(guī)劃和計劃、環(huán)境政策和項目等各層面，內(nèi)容涉及大氣、水、廢物和氣候變化等各領(lǐng)域。目前，圍繞政府環(huán)境審計實施，已經(jīng)形成了一套相對完善的實施運行機制和配套的制度及技術(shù)保障體系。政府環(huán)境審計已逐步成為政府環(huán)境管理與保護的最有效工具之一。

我國早在20世紀(jì)80年代開始在資金審計的基礎(chǔ)上，開展了部分資金使用績效的審計工作。為此，國家審計署專門成立了農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司，負責(zé)組織審計國務(wù)院主管部門和省級人民政府管理的資源能源、環(huán)境保護資金和項目。從環(huán)保部門來看，目前對各級政府環(huán)境質(zhì)量保護責(zé)任的落實，主要通過檢查評估和考核手段進行鑒證。由于考核手段偏軟，考核結(jié)果對地方政府領(lǐng)導(dǎo)干部難以產(chǎn)生實質(zhì)性影響，無法完全改變地方領(lǐng)導(dǎo)干部為追求政績而盲目破壞資源環(huán)境的做法，造成我國目前環(huán)境管理手段部分失靈，加劇了環(huán)境污染和生態(tài)破壞。

“十二五”以來，環(huán)境保護部對政府環(huán)境審計工作的重視程度不斷提高。2014年全國環(huán)境保護工作會議指出，要“研究推行環(huán)境審計制度，尤其是溯源審計，落實排污者責(zé)任”，并將建立環(huán)境審計制度作為2014年環(huán)境保護部重點改革任務(wù)之一。在環(huán)境保護部大力支持下，環(huán)境規(guī)劃院聯(lián)合中國環(huán)境與發(fā)展國際合作委員會、中國人民大學(xué)、南京大學(xué)等研究機構(gòu)，先后編制完成了《環(huán)境審計試點技術(shù)指南》及《企業(yè)環(huán)境核算技術(shù)指南》，完成《政府環(huán)境審計制度框架研究》、《環(huán)境審計評價指標(biāo)體系的建立和應(yīng)用》、《國際環(huán)境審計制度經(jīng)驗和案例研究》等多份研究報告，形成了建立和實施政府環(huán)境審計制度的總體技術(shù)框架。

隨著政府環(huán)境審計制度建設(shè)工作步伐的大大加快，2015年2月15日，環(huán)境保護部印發(fā)了《關(guān)于開展政府環(huán)境審計試點的通知》，標(biāo)志著政府環(huán)境審計工作的正式啟動。3月6日，《中國環(huán)境報》頭版報道“環(huán)境保護部下發(fā)《關(guān)于開展政府環(huán)境審計試點工作的通知》，決定在蘭州率先試點開展政府環(huán)境審計”，并在2版刊登了規(guī)財司司長趙華林專訪和蘭州市市長袁占亭署名文章。隨著試點深入開展，政府環(huán)境審計制度將不斷發(fā)展完善，并對我國環(huán)保工作產(chǎn)生巨大的推動性作用。